La Vía Verde Los Molinos de Agua dispone de varios accesos por carretera desde Huelva, Sevilla y otros municipios del entorno. Los principales puntos de entrada se encuentran en San Juan del Puerto, Beas, Trigueros y Valverde del Camino, conectados mediante la A-49, N-435 y distintas carreteras comarcales.
A lo largo del recorrido existen diferentes espacios habilitados para estacionar cómodamente junto a la vía verde o muy cerca de ella. También puedes consultar aquí las zonas de estacionamiento para caravanas.
La forma más cómoda de acceder en tren a la Vía Verde Los Molinos de Agua es a través de la estación de San Juan del Puerto, integrada en la línea de Media Distancia Sevilla–Huelva de Renfe.
Esta conexión ferroviaria permite llegar fácilmente desde ciudades como Sevilla o Huelva y acceder al inicio del recorrido situado junto al entorno de las Salinas y el Muelle del Tinto.